Marine Turtle DNA Sequences


Green turtle (Chelonia mydas) mitochondrial DNA control region sequences:
Atlantic and Mediterranean

 

To facilitate haplotype designations and to avoid confusion among ocean basins, we are using the nomenclature of CM-A# (prefix A before the number is used to designate that it is from the Atlantic basin; P will be used for the Pacific).

If you have a new sequence, please email the new sequence to ACCSTR (accstr@zoology.ufl.edu), and we will confirm the status of the sequence and assign a sequence designation number.  Sequences will not be posted on this webpage until the researcher who is the source of the new sequence gives permission.

It is the responsibility of the author of the new sequence to submit the sequence to GenBank (http://ncbi.nlm.nih.gov).  The data in GenBank are simultaneously made available to EMBL in Europe and the DNA Data Bank of Japan.

The table below summarizes the named haplotypes for Atlantic green turtles with GenBank Accession numbers and references.  Following the table, the named haplotype sequences are presented.

Sequence CM19 is not displayed because it was incorrectly assigned in Lahanas et al. 1998.  Sequence CM19 will not be reassigned to avoid confusion.

A typographical error was discovered in the GenBank sequence Z69887 for CM20 and Z69888 for CM21.  Correction of these sequences is pending.  Until these corrections are posted in GenBank, use the sequences below.


Full citations for the references cited in the table are given below the table.

CM sequence designation

GenBank Accession Number

Author/Reference

or Contact Person

CM-A1

Z50124

Encalada et al. 1996

CM-A2

Z50125

Encalada et al. 1996

CM-A3

M98394

Allard et al. 1994

CM-A4

Z50126

Encalada et al. 1996

CM-A5

Z50127

Lahanas et al. 1994

CM-A6

Z50128

Lahanas et al. 1994

CM-A7

Z50129

Lahanas et al. 1994

CM-A8

Z50130

Encalada et al. 1996

CM-A9

Z50131

Encalada et al. 1996

CM-A10

Z50132

Encalada et al. 1996

CM-A11

Z50133

Encalada et al. 1996

CM-A12

Z50134

Encalada et al. 1996

CM-A13

Z50135

Encalada et al. 1996

CM-A14

Z50136

Encalada et al. 1996

CM-A15

Z50137

Encalada et al. 1996

CM-A16

Z50138

Encalada et al. 1996

CM-A17

Z50139

Encalada et al. 1996

CM-A18

Z50140

Encalada et al. 1996

CM-A20

(see above)

Lahanas et al. 1998

CM-A21

(see above)

Lahanas et al. 1998

CM-A22

AF366251

Bass & Witzell 2000;

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A23

AF366252

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A24

AF366253

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A25

AF366254

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A26

AF366255

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A27

AF366256

Espinosa Lopez et al. 2000;

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A28

AF366257

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A29

AF366258

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A30

AF366259

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A31

AF366260

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A32

AF366261

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A33

AF366262

Bjorndal et al., in press

CM-A34

AF366263

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A35

--

Formia 2002

CM-A36

--

Formia 2002

CM-A37

--

Formia 2002

CM-A38

--

Formia 2002

CM-A39

--

Formia 2002

CM-A40

--

Formia 2002

CM-A41

--

Formia 2002

CM-A42

--

Formia 2002

CM-A43

--

Formia 2002

CM-A44

--

Formia 2002

CM-A45

--

Formia 2002

CM-A46

--

Formia 2002

CM-A47

--

Bjorndal & Bolten, unpublished

CM-A48

--

Bagley 2003;

Espinosa Lopez, unpublished

CM-A49

--

Bagley 2003

CM-A50

--

Formia, unpublished

CM-A51

--

Formia, unpublished

CM-A52

--

Formia, unpublished

CM-A53

--

Formia, unpublished

CM-A54

--

Meylan, pending

CM-A55

DQ294212

Naro-Maciel 2006

CM-A56

AJ543732

Espinosa Lopez, unpublished

CM-A57

AJ543735

Espinosa Lopez, unpublished

CM-A58

--

Abreu-Grobois, unpublished

CM-A59

EU491956

Levin et al., unpublished

CM-A60

EU491957

Levin et al., unpublished

References Cited

Allard, MW, MM Miyamoto, KA Bjorndal, AB Bolten, and BW Bowen.  1994.  Copeia 1994:34-41.

Bagley, DA.  2003.  Characterizing juvenile green turtles (Chelonia mydas) from three east central Florida developmental habitats.  MS thesis, University of Central Florida, Orlando, Florida, USA.

Bass, AL and WN Witzell.  2000.  Herpetologica 56:357-367.

Bjorndal, K.A., A.B. Bolten, L. Moreira, C. Bellini, and M.Â. Marcovaldi.  In press.  Chelonian Conservation and Biology.

Encalada, SE, PN Lahanas, KA Bjorndal, AB Bolten, MM Miyamoto, and BW Bowen.  1996.  Molecular Ecology 5:473-483.

Espinosa Lopez, G, G Hernandez Aguilera, M Jager, K Olavarria Gamez, ME Ibarra Martin, M Masselot, and J Deutch.  2000.  Proceedings of the Nineteenth Annual Symposium on Sea Turtle Biology and Conservation.  NOAA Technical Memorandum NMFS-SEFSC-443, pp 121-123.

Formia, A.  2002.  Population and genetic structure of the green turtle (Chelonia mydas) in West and Central Africa; Implications for management and conservation.  PhD dissertation, Cardiff University, UK.

Lahanas, PN, MM Miyamoto, KA Bjorndal, and AB Bolten.  1994.  Genetica 94:57-67.

Lahanas, PN, KA Bjorndal, AB Bolten, SE Encalada, MM Miyamoto, RA Valverde, and BW Bowen.  1998.  Marine Biology 130:345-352.

Naro-Maciel, E.  2006.  Connectivity and structure of Atlantic green sea turtles (Chelonia mydas): a genetic perspective.  PhD dissertation, Columbia University, USA.


 

CM-A1

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTACATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACTATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATTGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAGTCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAACGACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A2

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTACATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGGATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACTATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATTGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAGTCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAACGACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A3

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATTGTACATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACTATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATTGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAGTCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAACGACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A4

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATTGTACATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACTATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATTGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTTAGTCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAACGACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A5

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATATTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATGGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGCTT

TTCAGGCACATACAAGTAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTGAATTTA

 

CM-A6

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATATTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATGGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGCTT

TTCAGGCACATACAAGTAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A7

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATATTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATGGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGCTT

TTCAGGCACATACAAGTAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTGCCTTTGGTTGAATGAGTTCTATACATTGAATTTA

 

CM-A8

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATGGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGCTT

TTCAGGCACATACAAGTAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A9

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATGGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A10

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATGGGTTATTTCTTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGCTT

TTCAGGCACATACAAGTAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A11

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTAAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATGGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGCTT

TTCAGGCACATACAAGTAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A12

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATTGTCACAGTAATGGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGCTT

TTCAGGCACATACAAGTAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A13

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTACATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGACCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATTGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAGTCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAACGACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A14

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTACATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGACCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATTGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTAAGTCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAACGACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A15

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATTGTACATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAACATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACTATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATTGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAGTCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAACGACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A16

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTACATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGACCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATTGTCACAGTAATTGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAGTCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAACGACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A17

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTACATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGACCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATTGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAGTCTATGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAACGACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A18

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACTATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATTGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAGTCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAACGACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A20

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATATTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAGTTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATGGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGCTT

TTCAGGCACATACAAGTAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTGAATTTA

 

CM-A21

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATATTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATGGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTGAATTTA

 

CM-A22

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTACATCTACTTATTTACC

GATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATTGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAGTCTGTAACGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGTTT

TTCAGGCACATACAAGTAACGACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A23

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

GATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATGGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGCTT

TTCAGGCACATACAAGTAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A24

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATGGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGCTT

TTCAGGCACATACAAATAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTG----------AATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A25

AAGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTGCATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

AAATCATTGAATTTACATAAATATTTTAACAACATGAATATTAAGCAGAG

GATTAAAAGTGAAATGACATAGGACATAAAATTAAACCATTATACTCAAC

CATGAATATCGTCACAGTAATGGGTTATTTCCTAAATAGCTATTCACGAG

AAATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCA

TTCAATCTGTGGCGTACATAATTTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTAGCTT

TTCAGGCACATACAAGTAGCAACGTTCATTCGTTCCCCTTTAAAAGGCCT

TTGGTTGCAATGGGTTGAATGAGTTCTATACATTAAATTTA

 

CM-A26

?AGTGTCCACACAAACTAACTACCTAAATTCTCTGCCGTGCCCAACAGAA

CAATACCCGCAATACCTATCTATGTATTATCGTACATCTACTTATTTACC

AATAGCATATGACCAGTAATGTTAACAGTTGATTTGGCCCTAAACATAAA

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CM-A27

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CM-A28

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CM-A29

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CM-A30

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CM-A31

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CM-A32

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CM-A33

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CM-A34

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CM-A35

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CM-A36

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CM-A37

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CM-A38