Marine Turtle DNA Sequences
Loggerhead (Caretta caretta)
mitochondrial DNA control region sequences:
Atlantic and
To facilitate
haplotype designations and to avoid confusion among ocean basins, we are using
the nomenclature of CC-A#
(prefix A before the number is used to designate that it is from
the Atlantic basin; P will be used for the Pacific).
If you have a new
sequence, please email the new sequence to ACCSTR (accstr@zoology.ufl.edu), and
we will confirm the status of the sequence and assign a sequence designation
number. It is
the responsibility of the author of the new sequence to submit the sequence to GenBank (http://ncbi.nlm.nih.gov). The data in
GenBank are simultaneously made available to EMBL in
Europe and the DNA Data Bank of
The table below
presents the sequences for the named haplotypes for Atlantic loggerhead sea
turtles. We have renamed the haplotypes
"A through Q" (Bolten et al. 1998. Ecological Applications 8:1-7) to
CC-A1 through CC-A17.
|
CC-A1 through
CC-A17 |
Haplotypes A
through Q (Bolten
et al. 1998. Ecological
Applications 8:1-7) |
|
CC-A18 |
Bass et al.
2004. Conservation Genetics
5:783-796 |
|
CC-A19 through
CC-A23 |
unpublished;
contact Brian Bowen (bbowen@hawaii.edu)
|
|
CC-A24 and CC-A25 |
unpublished;
contact Anna Bass (hawksbill21@yahoo.com) |
|
CC-A26 through
CC-A32 |
Carreras et al.
2006. Marine Biology
149:1269-1279 |
|
CC-A33 through
CC-A35 |
unpublished;
contact Luciano Soares (lsoares@tamar.org.br) |
|
CC-A36 |
unpublished;
contact Alan Bolten (abb@zoology.ufl.edu)
|
|
CC-A37 CC-A40 |
Roberts et al. 2005. Conservation Genetics 6:133-139. Roberts et
al. haplotype designations were assigned as follows to conform to designations
used on this website: |
|
CC-A38 and CC-A39 |
These haplotype sequences have been removed
because they were incorrectly assigned.
CC-A38 and CC-A39 will not be assigned to other sequences to avoid
confusion. |
|
CC-A41 |
unpublished;
contact Alan Bolten (abb@zoology.ufl.edu)
|
|
CC-A42 |
unpublished;
contact Carlos Carreras (carreras@ebd.csic.es)
|
|
CC-A43 |
unpublished;
contact Brian Shamblin (brianshm@uga.edu) |
|
CC-A44 |
Reece et al.
2006. Conservation Genetics
7:345-352. Reece et al. incorrectly assigned haplotype number CCA36 to this
sequence; CC-A36
had already been assigned to another sequence. |
|
CC-A45 |
unpublished;
contact Kristen Mazzarella (ktmazz@juno.com) |
|
CC-A46 and CC-A47 |
unpublished,
contact Catalina Monzon (catalinama@iccm.rcanaria.es) |
|
CC-A48 |
Laurent et al. 1998. Molecular Ecology 7:1529-1542. Their haplotype “A6” converted
by Paolo Casale (paolo.casale@tiscali.it) |
|
CC-A49 |
unpublished,
contact Mark Roberts (mroberts@biol.sc.edu)
|
|
CC-A50 |
unpublished,
contact Paolo Casale (paolo.casale@tiscali.it) |
|
CC-A51 |
unpublished;
contact Brian Shamblin (brianshm@uga.edu) |
CC-A1
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCGCAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAGGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A2
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A3
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAACTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A4
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A5
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAA-TGAGTTCTATACATTAA
CC-A6
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGT-AAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A7
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAGGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A8
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A9
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
TT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACGGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A10
?????????ATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAGGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A11
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAGGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A12
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAGGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A13
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAATTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A14
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAATTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A15
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCGCAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGCTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAGGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A16
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGCAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A17
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCGCAGTAATGGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAGGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A18
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAAGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTTTTTGAGTTCTATACATTAA
CC-A19
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A20
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A21
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGCTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCGCAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAGGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A22
????????GATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCGCAGTAATAGGTTATTTCTTAGCTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAGGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A23
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTCAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCGCAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAGGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A24
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGTTACATGACTGTTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A25
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGCTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A26
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTGCAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A27
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACTATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCGCAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAGGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A28
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATGGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAAGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A29
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGCAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A30
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTCGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A31
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A32
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAACTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGT-AAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A33
???CATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TT-ATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGCTACATGACTATTATACAAGTA
ATAATAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAACTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAGCATTACCAGTTTCAGGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGGTAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A34
?????TATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TT-ATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGCTACATGACTATTATACAAGTA
ATAATAATGAAATGATATGGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAACTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAGCATTACCAGTTTCAGGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGGTAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A35
?AGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGACTTTAAACATAAAAA
TT-ATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGCTACATGACTATTATACAAGTA
ATAATAATGAAATGATATGGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAACTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAGCATTACCAGTTTCAGGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGGTAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A36
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAACTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTCATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAGGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A37
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAATTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATGGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAACCCTTGTTAGTAAGATACAACATTACCAGTTTCAAGCCCAT
TAAGTCATATCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTG-TTTTTT
CAGGCACATTAAGATAATAAAGTTCACTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTT------AAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A38
(incorrectly
assigned, removed from database)
CC-A39
(incorrectly assigned, removed
from database)
CC-A40
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATCTGACCTTAAACATAAAAA
CT-ATTAATTTTGCATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAGGAATGAAATGATATGGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTTACAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
AATAAGCAATCCTTGTTAGTAAGATACAATATTACCAGTTTCAAGTCCAT
TAAGTCATGTCGTACATAACTGATCTATTCTGGCCTCTGGTTGGTTTTTT
CAGGCACATTAAGGCAGTAAAGTTAATTCGTTCCTCTTTAAAAGGCCTCT
GGTTGCAAGTAAATGAGTTCTATACATTAA
CC-A41
TAGCATATGATCAGTAATGTTGTCGATTAATTTGGCTTTAAACATAAAAA
TTTATTAATTTTACATAAACTGTTTTAGTTACATGACTATTATACAGGTA
ATAAGAATGAAATGATATAGGACATAAAATTAAACCATTATTCTCAACCA
TGAATATCGTCGCAGTAATAGGTTATTTCTTAGTTCAGCTCATCACGAGA
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